大多数呼吸道病毒主要在后鼻咽部的纤毛柱状上皮细胞部位复制，前鼻孔和口咽部纤毛上皮细胞，也是多数病毒复制的部位。
因此，咽拭子的采集方式通常包括鼻咽拭子与口咽拭子，并且鼻咽拭子的病原检出率较口咽拭子高(但是这是基于能够正确规范进行鼻咽拭子采集的前提上)，所以一般多推荐进行鼻咽拭子采集。
鼻咽拭子采集标本可以进行抗原、核酸或细菌培养(如百日咳)检测，但是由于鼻咽拭子采集要求高于口咽拭子，临床上实际上并未予以重视。
鼻拭子的标本采集方法：
(1) .请让患者坐下，头向后倾斜一点，去除前鼻孔的分泌物
(2) .用拭子测量鼻孔到耳根的距离，用手指标记
(3) .轻轻插入鼻拭子至标记位置，或停止至有阻碍感，使鼻拭子在鼻内滞留15~30秒钟，轻轻旋转3圈。
(4) .慢慢拉出鼻拭子，迅速放入病毒取样管后，折断拭子，扔掉尾巴，完全放在管里。
(5) .拧紧管子盖，做好标记，放入生物安全袋中密封。
(6) .需要从两鼻孔采集时，分别使用一个拭子。
(7) .不能及时送到实验室进行检查，必须在低温下保存。
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