鼻咽拭子相对口咽拭子有以下几个优点：1．可以在咽部停留较长的时间，以便获得更足量的标本；2．患者耐受性好，熟练操作后基本可以在不麻醉的情况下取样，但初学时可先进行鼻腔粘膜的表面麻醉和收缩；3．取样者的暴露风险相对口咽拭子更低。
咽部分区包括鼻咽、口咽、喉咽，三者的黏膜是连续的，均属于上呼吸道的区域，鼻咽拭子和口咽拭子只是取样的路径不一样，经口取样是口咽拭子，经鼻取样为鼻咽拭子。但由于口咽拭子张口就能进行操作，相对简单，因此临床上比较常用，但取样者暴露的风险更高。
也有报道痰标本的敏感性高于咽拭子，但会增加痰液化这一步流程,也会因液化不理想而导致假阴性结果；支气管肺泡灌洗液标本采集难度大；收集粪便进行核酸检查不方便；在没有或难以获得呼吸道分泌物的被采样者，可以采集血液标本送检。所以，目前国内外仍以分离到***核酸阳性为确诊标准。第六版诊疗方案核酸检测不再强调检测的标本来源，只要*****检测阳性，就可以作为确诊病例了。但鼻咽拭子，仍是目前**为简便普及的方法。鼻咽拭子，仍是目前**为简便普及的方法2.确诊患者中咽拭子的阳性率大致为30%-50%。前段时间王辰院士在**电视台采访时提出，确诊患者中咽拭子的阳性率*为30%-50%；据四川大学华西医院刘焱斌网络始发的文献报道，对武汉市红十字会医院100例***肺炎病例同时留取咽拭子和鼻拭子，咽拭子阳性检出率54%，而鼻拭子取样标本的***核酸阳性率89%；综合分析如下：常见的客观原因是：鼻、咽拭子**常用，但与病程密切相关，早期***分布在上呼吸道，随着病情发展，上呼吸道***被***，而下呼吸道***载量反而升高，到后期可能就不易从鼻、咽拭子检出。常见的主观原因是：如果医务人员采样不熟练或位置不准确；刮取标本时患者的反应比较大。
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